F0基团将ATP合酶固定在线粒体内膜上，F1基团负责合成ATP。二者通过两个蛋白亚基链接在一起：转子与定子。“定子”在一侧将F1与F0连接起来。作用之一就是将跨膜质子动力势能转换成力矩，推动“转子”旋转。图2中转子引导F1的关键部位的构象周期性变化（一共又三种构象，对应结合ADP，反应，释放ATP三种），不断合成ATP。大自然不可能被全部了解，终极真理只能被逼近。ATP合成酶仍然有许多未解之谜，连当今科学家都无法突破：F0的精细结构图像究竟如何？质子流动与马达转动之间的具体相互作用形式？转子到底是如何储存势能，并将它化为化学能的？。。。这些关键问题的解决，必将让人类对生命的领悟更上一层楼，或许下一次突破将因你发生。

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