BP24 DNA-蛋白质的相互作用

目标:阐明 DNA-蛋白质复合物的复杂生物结构。

 

   蛋白质可以识别DNA的某些顺序，并与其结合。通过这种方式，它们可以阻止某种基因的表达。这时结合方式包括通过沃森-克里克碱基对与氨基酸侧链之间形成氢键，或者通过碱基对之间芳香侧链的插入，或者通过DNA沟中与α-螺旋或β-折叠的结合。

这个例子说明了一个α-螺旋是如何紧靠在DNA大沟内的，是基于一个同源域DNA复合物的晶体结构(参考: C.R. Kissinger et al., Cell 63, 579 (1990), 蛋白质数据库编码: 1hdd).

同源域是由60个氨基酸组成4条α-螺旋链相互缠绕成环而构成的。当与DNA形成一个复合物后， 其中一个α-螺旋会紧靠在DNA大沟内，从而在氨基酸侧链与核苷之间产生特殊作用。从图中可以清楚地看出，这里的两个同源域中仅包含3个α-螺旋链:仅有部分同源域与DNA结晶了。