BP07 肌红蛋白,一种球状蛋白

目标:用图示说明一种球状蛋白质——肌红蛋白的三级结构。

球状蛋白执行着细胞内发生的大部分化学反应。不像纤维蛋白那样,球状蛋白的多肽链折叠得很紧密(参见 BP10 和 11)。

 

 

一种典型的球状蛋白是肌红蛋白:其分子中肽链的 70%以α-螺旋形式存在(如红色部分所示)。8个α-螺旋结构域(有时以字母A到H来表示),以没有明确二级结构(黄色)的肽链相连,折叠形成一个球状结构。三维结构中的凹槽包含了一个辅基—血红素(一个带有二价铁原子的卟啉环,它的结构式表示在右边)。

在球状蛋白质中,疏水的残基位于蛋白质的中间,而亲水的残基位于表面,与水环境接触。

肌红蛋白的多肽链如图所示,α-螺旋结构域以红色螺旋表示,环以黄色的丝带形状表示,侧链未在图中标出,辅基以一个更具体的球和棍状模型表示,结合的氧分子及被基团占据的空间都被清楚地表示出来。此图来自菲利普(Phillips)确定的氧合肌红蛋白的晶体结构[参考:SEV Phillips, 在1.6A分辨率下氧合肌红蛋白的结构和提取,J. Mol. Biol. 142, 53(1 1980),蛋白质数据库编码: 1mbo]。